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如果小米手机的短信图标消失了，可能是因为应用被隐藏、被删除或系统出现小故障。可以尝试以下方法恢复短信应用图标。
1、检查应用是否被隐藏：在桌面上进行搜索，查看是否存在短信应用的图标，如果找不到图标，可能是应用被隐藏了，可以通过编辑桌面设置来取消隐藏应用。
2、重启设备：有时简单的重启设备可以解决一些临时性的软件问题。
3、检查应用管理：进入手机的设置，找到应用管理或者应用设置，查看短信应用是否存在于已安装的应用列表中，如果找不到，可能是应用被误删了，在这种情况下，可以尝试从应用商店重新下载并安装短信应用。
4、恢复出厂设置：如果以上方法都无法解决问题，可以考虑恢复出厂设置，但请注意，这将删除手机上的所有数据和设置，包括已安装的应用和存储的文件，在执行此操作之前，请务必备份重要数据。
以下是恢复出厂设置的步骤：
1、打开手机的设置。
2、找到“备份和重置”或“更多设置”选项。
3、选择“恢复出厂设置”。
4、在弹出的警告窗口中确认要执行此操作，然后点击“重置手机”。
完成上述步骤后，手机将自动重启并恢复到出厂设置状态，然后尝试查看短信应用是否已恢复，如果问题仍然存在，建议联系小米的客服或前往附近的售后服务点寻求帮助。